教育经历

2017-04至2020-03，东京大学，博士

2010-09至2013-06，吉林大学，硕士

2006-09至2010-06，吉林大学，学士

工作经历

2022-03至今，海南大学，计算机科学与技术学院，副教授

2020-04至2022-03，电子科技大学，基础与前沿研究院，博士后

研究方向

人工智能、计算生物学、生物信息学

主要研究工作集中在开发和利用人工智能方法对于生物学、药学中的多个交叉前沿和热点问题进行探索

基本介绍

张子龙，博士，海南大学计算机科学与技术学院副教授，博/硕士生导师，海南省“南海新星”第一批人才计划入选者，海南省D类高层次人才。中国计算机学会(CCF)生物信息学专业委员会委员，中国生物工程学会计算生物学与生物信息学(NCCBB)专业委员会委员，生物信息学与智能信息处理学术会议(BIIP)专业委员会委员，中国国家自然科学基金委(NSFC)函评专家，吴文俊人工智能科学技术奖评审专家。

获得海南省自然科学奖三等奖一项（排名第一），主持国家级自然科学基金地区项目一项、国家级自然科学基金青年项目一项、博士后国际交流引进项目一项（已结题）、合作主持国家级自然科学基金面上项目一项，主持海南省自然科学基金面上项目一项。以第一或通讯作者在Advanced Science、Research、Nano Letters等生物信息学顶级期刊或会议发表论文多篇。受邀担任Frontiers in Genetics、Machines等SCI期刊客座编辑，担任Nature Communications、Genome Biology等著名SCI期刊审稿人。

指导本科生发表第一作者SCI或CCF论文：

1. Cuilin Xiao, Zheyu Zhou, Jiayi She, Jinfen Yin, Feifei Cui, Zilong Zhang*. PEL-PVP: Application of plant vacuolar protein discriminator based on PEFT ESM-2 and bilayer LSTM in an unbalanced dataset. International Journal of Biological Macromolecules 2024; 277:134317. (中科院大类一区，影响因子7.7, TOP期刊, 肖萃林同学为2022级本科生，软件工程专业)

2. Yazi Li, Xiaoman Wei, Qinglin Yang, An Xiong, Xingfeng Li, Quan Zou, Feifei Cui*, Zilong Zhang*. msBERT-Promoter: a multi-scale ensemble predictor based on BERT pre-trained model for the two-stage prediction of DNA promoters and their strengths. BMC Biology 2024; 22(1):126.(中科院大类一区，TOP期刊，李亚子同学为2021级本科生，应用数学专业)

3. Yuanhao Li, Aoyun Geng, Zheyu Zhou, Feifei Cui, Junlin Xu, Yajie Meng, Leyi Wei, Quan Zou, Qingcheng Zhang, Zilong Zhang*. AVP-HNCL: Innovative Contrastive Learning with a Queue-Based Negative Sampling Strategy for Dual-Phase Antiviral Peptide Prediction. Journal of Chemical Information and Modeling 2025.(TOP期刊，李袁昊同学为2022级本科生，生态学专业)

4. Zheyu Zhou, Cuilin Xiao, Jinfen Yin, Hao Duan, Chunling Liu, Feifei Cui, Zilong Zhang*. PSAC-6mA: 6mA Site Identifier Using Self-Attention Capsule Network based on Sequence-Positioning. Computers in Biology and Medicine.(中科院小类一区，TOP期刊，周喆誉同学为2022级本科生，软件工程专业)

5. Ziyi Wang, Aoyun Geng, Hao Duan, Feifei Cui, Quan Zou, Zilong Zhang*. A Comprehensive Review of Approaches for Spatial Domain Recognition of Spatial Transcriptomes. Briefings in Functional Genomics 2024, 23(6):702-712.(王梓懿同学为2021级本科生，软件工程专业)

6. Jingwei Lv, Aoyun Geng, Zhuoyu Pan, Leyi Wei, Quan Zou, Zilong Zhang, Feifei Cui*. iBitter-GRE: A Novel Stacked Bitter Peptide Predictor with ESM-2 and Multi-View Features. Journal of Molecular Biology 2025, 437(8):169005. (吕经纬同学为2022级本科生，软件工程专业)

7. Yunyun Su, Shiyu Yan, Chen Cao, Feifei Cui, Quan Zou*, Zilong Zhang*. Human-Spa: An Online Platform Based on Spatial Transcriptome Data for Diseases of Human Systems. In: 2023 IEEE International Conference on Bioinformatics and Biomedicine (BIBM); 2023. pp. 293-298.(CCF-B会议，苏云云同学为2019级本科生，已保研进本课题组)

8. Haoye Qiu, Donglai Wang, Xiaoyang Liu, Feifei Cui, Zilong Zhang*. FCLNCM: Feature-Weight and Cluster-Weight Learning in Neutrosophic c-Means Clustering for Biomedical Applications. (审稿中，裘昊晔同学为2021级本科生，软件工程专业)

指导本科生大创项目
基于癌症基因表达数据的自适应加权中智C-均值聚类算法研究（项目负责人：裘昊晔）

基于Diffusion的高穿膜性环肽定向生成模型（项目负责人：周喆誉）

指导本科生竞赛

1. 周喆誉等同学参赛作品《基于深度学习的生物序列预测平台》获得中国高校计算机大赛全国一等奖

2. 李亚子等同学参赛作品《大语言模型在DNA启动子识别和强度预测中的综合运用：基于两阶段微调和集成学习的可解释性方法研究》全国大学生统计建模比赛广东赛区一等奖

3. 周喆誉、颜诗雨等同学参赛作品《基于深度学习的基因调控序列特征识别与分析研究》获得全国大学生生命科学竞赛（创新创业类）全国二等奖

4. 佘嘉怡等同学参赛作品《智能细胞器与抗病肽协同预测平台》获得全国大学生生命科学竞赛（创新创业类）全国三等奖

课程教学

算法设计与分析、机器学习、自然语言处理、图论及其应用、Python语言程序设计基础

个人主页

http://www.bioai-lab.com/info/zhangzilong

Ø 课题组长期招收博士后，欢迎邮件咨询；

Ø 欢迎感兴趣报考硕士、博士的同学随时联系（请勿向多位老师群发邮件），优先考虑具有计算机、统计、数学等相关背景的同学；

Ø 欢迎本科期间希望获得科研训练并取得科研成果的同学随时联系（请勿向多位老师群发邮件），一起学习、讨论、共同进步；

Ø 与英国剑桥大学、日本东京大学、沙特阿卜杜拉国王科技大学、澳大利亚莫纳什大学、电子科技大学等国内外科研院校具有良好合作关系，优秀者可推荐前往深造、访学。